Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGA5P08648 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ITGA5P08648 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms