Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CENPBP07199 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CENPBP07199 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CENPBP07199 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms