Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPTA1P02549 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms