Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX58O95786 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX58O95786 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX58O95786 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX58O95786 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX58O95786 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms