Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
POLR1AO95602 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POLR1AO95602 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms