Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG7O95352 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG7O95352 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG7O95352 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms