Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN7O94888 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms