Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ECM2O94769 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ECM2O94769 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ECM2O94769 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ECM2O94769 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ECM2O94769 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms