Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP2O75323 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms