Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms