Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNC1O60486 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNC1O60486 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms