Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HTRA2O43464 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HTRA2O43464 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms