Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SGSM2O43147 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms