Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
U2SURPO15042 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms