Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BHLHE40O14503 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms