Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBXN8O00124 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UBXN8O00124 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms