Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms