Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
B4DXG7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
B4DXG7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
B4DXG7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
B4DXG7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms