Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GOLGA6L4A6NEF3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms