Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALM3A6NDB9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms