Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LRP5LA4QPB2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRP5LA4QPB2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms