Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC144AA2RUR9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC144AA2RUR9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms