Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCOA3Q9Y6Q9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms