Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC4Q9Y296 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC4Q9Y296 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms