Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNND2Q9UQB3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms