Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms