Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDZRN3Q9UPQ7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms