Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNRF3Q9ULT6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNRF3Q9ULT6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms