Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF346Q9UL40 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF346Q9UL40 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms