Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC9Q9UKV0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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