Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms