Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1L1Q9UHC9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1L1Q9UHC9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms