Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VTI1BQ9UEU0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms