Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CFDP1Q9UEE9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CFDP1Q9UEE9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms