Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TFIP11Q9UBB9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TFIP11Q9UBB9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms