Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRP2BPQ9P2M1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms