Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIS18AQ9NYP9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIS18AQ9NYP9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms