Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZDHHC3Q9NYG2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms