Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GDAP2Q9NXN4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms