Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM28Q9NW13 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms