Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM30AQ9NV96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM30AQ9NV96 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms