Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKDREJQ9NTG1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms