Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG3Q9NT62 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG3Q9NT62 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms