Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTNNBIP1Q9NSA3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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