Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CLSPNQ9HAW4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLSPNQ9HAW4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms