Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UPF2Q9HAU5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPF2Q9HAU5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms