Protein–RNA interactions for Protein: Q9H999

PANK3, Pantothenate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK3Q9H999 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PANK3Q9H999 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANK3Q9H999 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANK3Q9H999 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANK3Q9H999 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANK3Q9H999 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PANK3Q9H999 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms