Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB1BQ9H0U4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB1BQ9H0U4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms