Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RSPH6AQ9H0K4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RSPH6AQ9H0K4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms