Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BPESC1Q9GZL8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BPESC1Q9GZL8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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